Il cotone colorato è stato sviluppato dagli Incas 4500 anni aC, come pure da altri antichi popoli delle Americhe, Africa e Australia. Tuttavia il suo uso era limitato alle imbarcazioni per avere fibre debole e irregolari. Le specie più primitive di fibre di cotone sono state colorate principalmente in tonalità marroni. In Brasile, sono stati raccolti da piante di cotone selvaggio nelle tonalitá crema tono e marrone, mescolate con cotone bianco della specie G. barbadense L. e G. hirsutum Marie Galante gara Hutch, noto come albero del cotone. Questi cotoni colorati sono stati sempre considerati indispensabili per le miscele industriali, avendo soltanto uso artigianali e da utilizzare solo a scopo ornamentale, soprattutto negli stati di Bahia e Minas Gerais. Queste piante di cotone sono state conservate in banche genetiche Embrapa cotone, in Patos, PB, a partire dal 1984. Dal 1989 sono iniziati i lavori di riproduzione, dopo una visita da parte di produttori tessili giapponesi, che hanno dimostrato interesse ad acquisire questo tipo di fibra.

In Brasile, nell’Embrapa, il ricercatore Napoleone Macedo ha spiegato che il cotone BRS 200 fu ottenuto a partire de miglioramenti genetici, dalla riproduzione di una specie di cotone nativo per regione semi-arida del nordest brasiliano, chiamato Moco. I ricercatori hanno osservato che alcune di queste piante presentavano di forma alleatoria una colorazione marrone. A loro toccò il compito di combinare, nella stessa specie, i geni responsabili del colore ed i geni che producono le piante di fibre più resistenti. Grazie a questo intervento tecnologico é stato possibile produrre un cotone commercialmente accettabile. Inizialmente si era proceduto ad una valutazione della produttività e delle caratteristiche delle fibre di 11 accessi ad alberi di cotone colorato esistenti in banche genetiche. Si è constatato che la lunghezza della fibra di colore variava daí 25,9 ai 31,6 mm, la resistenza era molto bassa, con il 60% dei materiali che vanno dal 19,5-21,7 GF / tex, che impedirebbe la sua industrializzazione nei fissaggi moderni, che esigono cotoni di alta resistenza. Le fibre erano anche troppo sottili e di bassa uniformità.